Guía de uso Genetics Lab

Cómo se usa Genetics Lab

La herramienta con un inserto y un vector cargados
ESCRIBE AQUÍ el pie de la captura

Del gen al plan de clonación, paso a paso: qué cargar, qué mira la herramienta en cada pantalla y qué llevarse al banco.

Antes de empezar

No hay que instalar ni registrarse: todo el cálculo ocurre en tu navegador y ninguna secuencia sale de tu ordenador. Hace falta el gen que quieres clonar y el plásmido donde va a entrar, en GenBank, FASTA o SnapGene, o un número de acceso de NCBI.

ESCRIBE AQUÍ lo que quieras contar de para quién es y qué hace falta saber antes.

1. Cargar el gen y el plásmido

ESCRIBE AQUÍ el paso, con lo que ves en pantalla.

Cuadro de carga del inserto y del vector
ESCRIBE AQUÍ el pie

2. Elegir el tramo que se clona

ESCRIBE AQUÍ: el registro entero o solo el CDS, y qué cambia según lo que elijas.

3. Elegir la pareja de enzimas

ESCRIBE AQUÍ: la tabla de parejas, el veredicto de cada una y el motivo del descarte.

Si el protocolo te da las enzimas, se escriben en «Usar estas enzimas» y la pareja aparece en la tabla con el mismo examen que las demás, esté entre las propuestas o no.

Tabla de parejas de enzimas con su veredicto
ESCRIBE AQUÍ el pie

4. Los cebadores

ESCRIBE AQUÍ: la pinza, la diana y la zona que hibrida, y cuál de las dos temperaturas se usa para poner la PCR.

5. El plásmido que sale

ESCRIBE AQUÍ: el mapa del constructo, dónde quedó el inserto y qué se descarga.

6. El gel y la comprobación

ESCRIBE AQUÍ: cómo leer el gel simulado.

En «Comprobación» eliges una enzima o varias y salen dos carriles juntos, el plásmido que buscas y el vector de partida cortados igual, con una frase que dice si ese gel los distingue. Es lo que se mira después de transformar, cuando hay que saber si la colonia lleva el constructo o el plásmido de partida.

7. Clonar en varios pasos

Para meter dos insertos en el mismo plásmido, el producto de un paso pasa a ser el vector del siguiente: en la pestaña Producto, «Usar como vector del siguiente paso». El paso que dejas atrás se queda guardado con sus cebadores y su gel, y encima del mapa aparece «Volver a» para regresar a él.

A partir de ahí, la herramienta protege lo que ya está dentro: descarta las parejas que cortarían el primer inserto o que se lo llevarían en el trozo que se retira, y lo dice.

ESCRIBE AQUÍ el ejemplo que quieras contar.

8. Guardar, volver y compartir

ESCRIBE AQUÍ: los proyectos se guardan solos en el navegador, se descargan como archivo y se vuelven a abrir en otro ordenador.

Novedades

Lo que va cambiando en la herramienta, de lo más reciente a lo más antiguo.

  • Por publicar — Clonación en varios pasos: encadenar un paso con el siguiente, protección de lo ya clonado, elegir la pareja a mano, volver a cualquier paso y el carril de comprobación del gel.
  • v2.5 — ESCRIBE AQUÍ lo que entró en esta versión.