From the gene to the cloning plan, step by step: what to load, what the tool looks at on each screen and what to take to the bench.
No hay que instalar ni registrarse: todo el cálculo ocurre en tu navegador y ninguna secuencia sale de tu ordenador. Hace falta el gen que quieres clonar y el plásmido donde va a entrar, en GenBank, FASTA o SnapGene, o un número de acceso de NCBI.
ESCRIBE AQUÍ lo que quieras contar de para quién es y qué hace falta saber antes.
ESCRIBE AQUÍ el paso, con lo que ves en pantalla.
ESCRIBE AQUÍ: el registro entero o solo el CDS, y qué cambia según lo que elijas.
ESCRIBE AQUÍ: la tabla de parejas, el veredicto de cada una y el motivo del descarte.
Si el protocolo te da las enzimas, se escriben en «Usar estas enzimas» y la pareja aparece en la tabla con el mismo examen que las demás, esté entre las propuestas o no.
ESCRIBE AQUÍ: la pinza, la diana y la zona que hibrida, y cuál de las dos temperaturas se usa para poner la PCR.
ESCRIBE AQUÍ: el mapa del constructo, dónde quedó el inserto y qué se descarga.
ESCRIBE AQUÍ: cómo leer el gel simulado.
En «Comprobación» eliges una enzima o varias y salen dos carriles juntos, el plásmido que buscas y el vector de partida cortados igual, con una frase que dice si ese gel los distingue. Es lo que se mira después de transformar, cuando hay que saber si la colonia lleva el constructo o el plásmido de partida.
Para meter dos insertos en el mismo plásmido, el producto de un paso pasa a ser el vector del siguiente: en la pestaña Producto, «Usar como vector del siguiente paso». El paso que dejas atrás se queda guardado con sus cebadores y su gel, y encima del mapa aparece «Volver a» para regresar a él.
A partir de ahí, la herramienta protege lo que ya está dentro: descarta las parejas que cortarían el primer inserto o que se lo llevarían en el trozo que se retira, y lo dice.
ESCRIBE AQUÍ el ejemplo que quieras contar.
ESCRIBE AQUÍ: los proyectos se guardan solos en el navegador, se descargan como archivo y se vuelven a abrir en otro ordenador.
Lo que va cambiando en la herramienta, de lo más reciente a lo más antiguo.